Forskare vid University of Aberdeen har utvecklat en ny teknik som kan hjälpa till att identifiera källan till matförgiftning eller infektion snabbare och mer exakt än nuvarande metoder.

Framsteg inom hela genom -sekvensering (WGS) innebär att den fullständiga DNA -sekvensen för en organisms genom kan erhållas vid en enda tidpunkt.

Men metoder för att effektivt utvinna denna mängd information för infektionskontroll är ännu inte fullt utvecklade.

Skriver i tidningen Vetenskapliga rapporter , forskarna skisserar en ny teknik som de visade kunde matcha campylobacter och eventuellt andra vanliga livsmedelsburna patogener mer exakt till deras ursprungskälla inom en betydligt reducerad tidsram.

Campylobacter-bakterierna orsakar mer livsmedelsburna sjukdomar än någon annan organism, men det är ofta svårt att hitta var en patient förvärvat infektionen eftersom den kan härröra från flera djurreservoarer inklusive nötkreatur, kyckling, grisar, får och vilda fåglar.

Tekniken som utvecklats av Aberdeen -forskarna bygger på en ny metod för maskininlärning - känd som metoden för minimalt multilokusavstånd (MMD) - som kan användas för att 'träna' en dator för att identifiera troliga källor med hög noggrannhet.

Studien leddes av Dr Francisco Perez Reche och professor Norval Strachan, både från University of Aberdeens avdelningar för fysik och biologiska vetenskaper.

Dr Perez Reche sa:"Det finns ett antal befintliga metoder för att beräkna den troliga källan till en infektion, men för att fungera effektivt, de använder antingen bara en del av genomets sekvensering, vilket innebär att resultaten är mindre riktade, eller om de använder hela genomet, beräkningarna kan ta upp till två dagar att utföra.

"När man hanterar ett infektionsutbrott, hastighet och noggrannhet för att identifiera den troliga källan är nyckeln.

"Vår MMD -metod tränar datorn för att inom några sekunder identifiera troliga ursprungskällor till en campylobacterinfektion."

Professor Strachan tillade:"Detta har potential att snabbt ge information om den potentiella infektionskällan och kan användas för att informera strategier för att minska matförgiftning."

Tekniken har demonstrerats på en teoretisk nivå men ytterligare forskning kommer att krävas för att bygga in den i teknik som kan vara till hands för hälso- och sjukvårdspersonal.

Förutom dess användning vid matförgiftning, forskarna undersökte också hur den kan tillämpas på mänsklig utveckling genom att matcha individer med befolkningar, för att bestämma den geografiska spridningen av olika arter och för att bestämma typen av bröstcancertumörer.