Imaging mass spectrometri (IMS) gör det möjligt att se den rumsliga fördelningen av molekyler i ett tunt vävnadssnitt baserat på deras molekylära massor. Det är ett kraftfullt verktyg för upptäckt av biomarkörer, men att identifiera proteiner som upptäckts av IMS är fortfarande en svår uppgift.

Jeffrey Spraggins, Ph.D., och kollegor i Mass Spectrometry Research Center, rapporterar nu en förbättrad teknologi för proteinidentifiering i IMS.

Utredarna automatiserade ytanalys av vätskeextraktion, vilket innebär att små volymer lösningsmedel doseras på vävnadens yta för att extrahera proteiner och andra föreningar, följt av traditionella proteinidentifieringstekniker (proteomiska).

Den 15 mars Snabb kommunikation inom masspektrometri , de rapporterar mikroextraktioner av robotytor från tunna vävnadssnitt med en glaskapilläruppsättning, kopplas direkt till vätskekromatografi/masspektrometri för proteomisk analys. De fann förbättrad reproducerbarhet och droppupplösning med robotextraktionen.

Att koppla extraktionen direkt till analysen är mer lämpad för rumsliga proteomiska experiment med hög genomströmning och kommer att hjälpa till i utmaningen att identifiera proteiner som observerats av IMS.