Forskare från North Carolina State University har skapat en ny onlinetjänst – ChemMaps – som låter användare interaktivt navigera i det kemiska utrymmet för över 8, 000 droger och 47, 000 miljöföreningar i 3D och realtid. ChemMaps är designat för att vara en central resurs för studenter och forskare som enkelt vill visualisera och studera komplicerade uppsättningar av kemiska strukturer.

Den första utgåvan av den gratis att använda webbplatsen finns på http://www.chemmaps.com.

"Förutsättningen för ChemMaps var att göra det till Google Maps över droger, säger Denis Fourches, biträdande professor i kemi vid NC State. "Den gör det möjligt för alla som använder en dator eller en surfplatta att enkelt bläddra och navigera i det kemiska utrymmet för marknadsförda läkemedel i en 3-D-miljö. Vi ville verkligen göra det grafiska gränssnittet i ChemMaps relevant för en student eller för en specialist inom medicinsk kemi. "

Med ChemMaps, kemikalierna ser ut som stjärnor – ljuspunkter utspridda över skärmen. Varje stjärna, eller sammansatt, är placerad i förhållande till de andra inom det komplexa kemiska rummet baserat på deras strukturella egenskaper. När en användare klickar på en viss sammansatt stjärna, flera nyckelegenskaper hos den kemikalien visas:dess systematiska namn, varumärke, kemisk struktur, medicinsk indikation, externa identifierare, och andra fysikalisk-kemiska egenskaper.

För närvarande, det finns två huvudkartor tillgängliga. DrugMap innehåller cirka 8, 000 droger (marknadsförda, under utveckling och tillbakadragen) och har tagits fram från databasen DrugBank. Miljökartan, eller EnvMap, inkluderar över 47, 000 föreningar (såsom bekämpningsmedel eller flamskyddsmedel) av relevans för National Institute of Environmental Health Studies (NIEHS) och United States Environmental Protection Agency (EPA) och framställdes från Tox21, Toxcast, och andra NIEHS-databaser.

Forskarna planerar att lägga till funktioner över tid, inklusive möjligheten för samarbetspartners och företag att visualisera och projicera proprietära uppsättningar av kemikalier på ChemMaps. De planerar också att göra kartorna ännu mer interaktiva, lätt att manipulera, och kompatibel med enheter med förstärkt och virtuell verklighet.

"Detta är det första verktyget i det offentliga området som tillåter vem som helst, särskilt icke-experter inom kemiformatik, att lätt, visuellt och snabbt få tillgång till all denna komplexa kemiinformation på ett ställe, Fourches säger. "Detta verktyg kan hjälpa forskare att bättre förstå den kemiska grannskapet av en viss förening. Faktiskt, detta är avgörande för att använda läkemedel eller kemisk riskbedömning."

Forskningen dyker upp i Bioinformatik . Dr Alex Borrel, tidigare NC State postdoktor för närvarande vid NIEHS och första författare till uppsatsen, skapade programmet. Fourches skapade ChemMaps och är motsvarande författare. Dr Nicole Kleinstreuer, beräkningsbiolog vid NIEHS, också bidragit till arbetet.