* Atomen är mestadels tomt utrymme: Det faktum att de flesta alfapartiklar passerade rakt genom guldfolien utan att avledas innebar att atomen inte var en solid, ogenomtränglig sfär som tidigare trott. Istället måste det vara mestadels tomt utrymme.
* Atomen har en liten, tät, positivt laddad kärna: De få alfapartiklar som avleddes i stora vinklar indikerade närvaron av en mycket liten, tät, positivt laddad region inom atomen, som han kallade kärnan. Denna kärna är ansvarig för att innehålla nästan hela atommassan.
* Elektroner kretsar om kärnan: Rutherfords modell föreslog att elektroner kretsar runt kärnan som planeter kretsar runt solen. Emellertid reviderades denna modell senare av Bohr och andra för att redogöra för elektronernas kvant.
Sammanfattningsvis vände Rutherfords experiment plommonpuddingmodellen för atomen och ledde till utvecklingen av kärnkraftsmodellen, som förblir grunden för vår förståelse av atomstrukturen.
