Skadegörare riktar ofta till specifika typer av växter. När livsmiljöerna förstörs och växternas mångfald minskar, innehåller miljön mer av en viss typ av växt. Detta underlättar spridningen av skadedjur. Växtdiversiteten tillhandahåller livsmiljöer för en större variation av insekter och andra djur och för skadedjurens naturliga fiender. Svampväxtsjukdomar är allvarligare i monokulturområden där en enda grödor odlas.
Indirekta effekter

Produktionen av mat, kläder och skydd för människor beror på många indirekta sätt på ekosystemens biologiska mångfald. . En stor mångfald av jordbruksgrödor skyddar jordbrukarna mot grödfel. Förstörelse av livsmiljöer och minskning av artens mångfald kan göra ekosystemen mer sårbara för invasiva arter och indirekt påverka människors hälsa och välbefinnande. Effekten av invasiva arter illustreras av vad som hände när bas introducerades i Gatun Lake, Panama. Förekomsten av bas resulterade i minskning av rovdjur av mygglarver och en ökning av förekomsten av malaria.