Mycket få bakterier producerar endosporer. Endast några av dessa arter i Firmicute-filylen producerar endosporer, som är icke-reproduktiva strukturer som innehåller DNA och en del av cytoplasma. Endosporer är inte riktiga sporer eftersom de inte är avkomma till bakterien. Endosporer bildas när bakterier utsätts för extrema eller ogynnsamma miljöförhållanden. De kan överleva under långa perioder även om de utsattes för mat och när de utsätts för kemikalier och temperaturer som normalt skulle döda bakterierna.
Bacillus Bacteria

Bakterier i släktet Bacillus är de vanligaste studierna av alla endospore- producerar bakterier. Bacillusbakterier är olika och trivs i många olika miljöer. Endosporerna av denna bakterie är mycket giftiga för många organismer, inklusive människor. Patogenen Bacillus anthracis är ett välkänt toxin som har använts av både forskare och terrorister. Det finns emellertid många andra arter av Bacillus.
Clostridium Bacteria

Liksom andra arter av endospor-producerande bakterier är Clostridium-bakterier grampositiva, vilket indikerar att de har liknande egenskaper såsom cellväggstruktur. Grampositiva bakterier är känsliga för samma eller nära besläktade antibiotika. Bakterier i släktet Clostridium är ansvariga för ett brett spektrum av mänskliga sjukdomar som sträcker sig från mild matförgiftning till botulism samt stivkramp och gasgreen. släktet Desulfotomaculum ansvarar också för matskämning och sjukdom. Desulfotomaculum-bakterier kan orsaka dåligt konserverade livsmedel. Där de är i överflöd ger de en obehaglig svavelliknande lukt.