I människor, det finns mer än 50 typer av aminosyratransportörer, som är ansvariga för det cellulära upptaget av aminosyror och för att reglera den intra- och extracellulära balansen av dessa molekyler. Mutationer i dessa transportörer är förknippade med en mängd olika sjukdomar. Dock, trots betydelsen av dessa molekyler, lite är känt om hur de fungerar. Forskare vid Institutet för forskning i biomedicin (IRB Barcelona) har nu karakteriserat strukturen hos en medlem av LAT-familjen.

LAT bildar en familj som inkluderar olika typer av aminosyratransportörer, och finns till och med i vissa typer av bakterier. Muterade LAT är förknippade med så olika tillstånd som autism, åldersrelaterad hörselnedsättning, cystinuri och lysinurisk proteinintolerans.

Publicerad i tidskriften Naturkommunikation , denna studie har fokuserat på BasC, en LAT som finns i bakterier. "Vi har använt BasC som modell eftersom det visar strukturell och funktionell likhet med LAT hos människor, " förklarar Manuel Palacín, chef för Amino Acid Transporters and Disease Lab vid IRB Barcelona.

Genom att analysera strukturen och funktionen av BasC, de första författarna till detta verk, Ekaitz Errasti-Murugarren, Joana Fort och Paola Bartoccioni, postdoktorer vid IRB Barcelona, har identifierat platsen där aminosyror binder till LAT och mekanismen som ligger till grund för interaktionen på båda sidor av cellmembranet.

"Att veta hur LATs känner igen aminosyrorna som ska transporteras in i cellen gör att vi bättre kan förstå deras funktion och dechiffrera de molekylära defekterna som är förknippade med olika tillstånd. Denna kunskap kommer sedan att hjälpa oss att utveckla potentiella behandlingar, " kommenterar Palacín, professor vid biologiska fakulteten vid universitetet i Barcelona, och chef för enhet U731 i Centro de Investigación Biomédica en Red de Enfermedades Raras (CIBERER).

I detta samarbete mellan IRB Barcelona, CIBERER, IBMB-CSIC och Barcelona Supercomputing Center, forskarna har karakteriserat strukturen hos BasC med hjälp av röntgenkristallografi och med en antikropp mot denna transportör. "BasC-antikropparna som vi utvecklade ger ett utmärkt verktyg för att studera funktionen hos denna transportör, ", tillägger Palacín.