RNA-polymeras II (RNA Pol II) är enzymet som adderar nukleotider till en ny DNA-kedja som produceras under transkription. Det rekryteras till transkriptionsstartpunkten för en gen av ett kluster av transkriptionsfaktorer som binder TATA-rutan, vilket är en sekvens av nukleotider nära genlinjen i utgången. Dessa transkriptionsfaktorer kallas TFII-familjen (för transkriptionsfaktor för polymeras II) av proteiner. Dessa transkriptionsfaktorer hjälper RNA-polymeras II att börja röra sig längs det avlindade DNA. När den rör sig längs, kopplar den nukleotiderna till en ny kedja genom att matcha de fria flytande nukleotiderna med deras motsvarande baspar på DNA-mängden. DNA-prokaryotisk transkription
Bakteriell RNA-polymeras II är ett multi-subenhet proteinkomplex. I stället för att rekryteras till transkriptionsstartplatsen av TFII-familjeproteiner - som händer med den eukaryota versionen - har bakteriell RNA Pol II en subenhet kallad sigmafaktorn. Sigma-faktorn tar hela RNA Pol II-komplexet till genens startlinje. Sigma-faktorn hjälper till att öppna DNA-dubbelhelixen, så att det bakteriella RNA Pol II-komplexet glider längs en DNA-sträng och börjar lägga till nya nukleotider.
DNA-replikering
DNA-replikering brukar likna mellan eukaryoter och prokaryoter. Replikationen är annorlunda än transkription genom att båda DNA-strängarna kopieras samtidigt - båda DNA-strängarna fungerar som mallar. Vid DNA-replikation produceras en sträng av nytt DNA som en kontinuerlig kedja (kallad ledsträngen), medan den andra strängen av nytt DNA är gjord i korta diskontinuerliga bitar (kallad släpsträngen). DNA-polymeras III är enzymet som adderar nukleotider för att göra den kontinuerliga ledande strängen. Ett annat polymeras, DNA-polymeras I, adderar nukleotider för att göra de diskontinuerliga fragmenten (kallad Okazaki-fragment) på den släpande strängen.
Mer än ett polymeras
Det finns fem DNA-polymeraser i bakterier och 15 i människor. De hör i allmänhet till tre olika klasser: A, B och X. DNA Pol III, som gör den ledande strängen under DNA-replikering, är en klass A-typ och gör mycket långa strängar (30 000 nukleotider) innan de faller av DNA. DNA Pol I, som gör de korta diskontinuerliga Okazaki-fragmenten på den släpande strängen, tillhör klass B - det gör fragment som är omkring 600 nukleotider långa. Slutligen innehåller klass X polymeraser som är involverade i reparation av skadat DNA. De lägger också till nukleotider, men i form av korta kedjor.
