Forskare har förmåga att sekvensera DNA-molekylen; Med andra ord kan de bestämma ordningen av nukleotidbaser i vilken som helst given molekyl. Sekvensering av DNA-molekylen kan vara det första av ett antal steg som behövs för att räkna ut hur de specifika nukleotider i en DNA-molekyl interagerar med varandra och kod för olika egenskaper i en organism. Processen att sekvensera DNA är ganska involverad, men automatiska DNA-sekvenserare är att minimera mänsklig inblandning krävs, för åtminstone en del av processen.

Provberedning

För en automatisk DNA-sekvenserare att arbeta, den måste detektera de fyra nukleotidbaserna som utgör DNA: adenin, guanin, tymin och cytosin. Forskare kopierar en bit DNA många gånger och använder restriktionsenzymer för att skära DNA i bitar av olika storlekar. De lägger sedan till en liten mängd fluorescerande märkt bas till varje sats DNA. Basen, som är antingen adenin, tymin, guanin eller cytosin, kommer att binda till sitt baskomplement i slutet av en sträng. Till exempel, kommer adenin binda till strängar som slutar med tymin och guanin kommer att binda till strängar slutar med cytosin.

Automatisk DNA Sequencer Konstruktion

En automatisk DNA-sekvenserare är byggd ungefär som en DNA-sekvenserare som kräver mer manuell arbetskraft. Specifikt är en automatisk DNA-sekvenserare en tank, ca 1 fot lång, med 96 gelbrunnar i vilka DNA kan hällas. I en automatisk DNA sekvenserare, precis som i varje DNA-sekvenserare, är det DNA injiceras i gelén brunnar vid toppen av tanken, och en negativ laddning anbringas på den ände av tanken. Den negativa laddningen ger en stark drivkraft för DNA-strängarna för att resa olika avstånd, till änden av tanken.

Automatisk Injicerbara

En automatisk DNA-sekvenserings injicerar satser av DNA, automatiskt, in i toppen av gelén. Som sådan sparar det forskare en enorm tid och ansträngning. Efter att satserna injiceras applicerar sekvensomvandlaren automatiskt en negativ laddning till den ena änden av tanken, vilket medför att strängarna migrerar varierande avstånd genom gelén. De olika avstånd återspeglar de olika storlekar av DNA-strängar som passerar genom gelén.

Detector

Många automatiska DNA-sekvenseringsmaskiner är inrättat för att detektera det fluorescerande färgämnet på DNA-strängarna som passerar genom gelén . Genom att göra det kan de identifiera nukleotiderna som ligger i ändarna av strängar och spela in dem i datorn. Emellertid presenterar sekvenser i bästa fall en jumbled upp version av DNA-nukleotider. Efter att ha använts en automatisk DNA-sekvenseringsmaskin måste du gå igenom en process som kallas "finishing", där en kombination av datorer och forskare sorterar ut resultaten från DNA-strängen som upptäcker att data sätts i en omfattande beskrivning av en DNA-sträng. Inte överraskande kan denna process ta mycket längre tid än den faktiska sekvenseringsprocessen.