Här är varför:
* Northern blotting använder en agarosgel, inte en polyakrylamidgel. Polyakrylamidgeler används i SDS-PAGE (natriumdodecylsulfat polyakrylamidgelelektrofores), som separerar proteiner efter storlek. Formaldehyd används i vissa SDS-PAGE-protokoll för att upprätthålla integriteten i proteinstrukturen.
* Northern blotting mål RNA, inte proteiner. RNA separeras efter storlek med användning av en agarosgel, inte en polyakrylamidgel. Formaldehyd är inte nödvändig för att upprätthålla RNA -struktur i detta sammanhang.
Här är vad som används i Northern blotting gelberedning:
* agaros: En polysackarid som bildar en gelmatris som separerar RNA -molekyler efter storlek.
* buffert: Vanligtvis Tris-Borate-EDTA (TBE) eller Tris-acetate-EDTA (TAE) buffert, vilket ger ett ledande medium för elektrofores.
* formaldehyd (valfritt): Formaldehyd läggs ibland * till elektroforesbufferten under norra blotting, men detta är inte för att förbereda gelén själv. Det används för att denaturera RNA -molekylerna, vilket säkerställer att de migrerar genom gelén baserat på storlek ensam, inte struktur.
Sammanfattningsvis: Formaldehyd spelar ingen roll i Northern blotting gelpreparat. Det används i vissa protokoll för att denaturera RNA -molekyler under elektrofores, men inte i själva gelén.
