Järn har högre densitet än trä eftersom järnatomerna packas tätare ihop. Ett materials densitet definieras som dess massa per volymenhet. Ett föremåls massa bestäms av antalet atomer det innehåller, medan ett föremåls volym bestäms av hur mycket utrymme det tar upp. Järnatomer är mycket tyngre än träatomer, och de är också tätare packade. Det betyder att järn har en högre massa per volymenhet än trä, vilket ger det en högre densitet.

Dessutom är atomerna i järn ordnade i en regelbunden, kristallin struktur, medan atomerna i trä är ordnade i en mer slumpmässig, amorf struktur. Detta bidrar också till den högre densiteten av järn, eftersom det regelbundna arrangemanget av atomer gör att de kan packas tätare tillsammans.