* vätesulfid (H₂S): Dessa organismer finns i hydrotermiska ventiler och andra miljöer och oxiderar H₂s till svavel och släpper energi i processen. Detta är en vanlig energikälla för många djuphavsorganismer.
* ammoniak (NH₃): Vissa bakterier använder ammoniak som en energikälla genom att oxidera den till nitrit (NO₂⁻). Denna process är viktig i kvävecykeln.
* järn (Fe²⁺): Vissa bakterier kan oxidera järnjärn (Fe²⁺) till järnjärn (Fe³⁺) för att erhålla energi. Denna process observeras ofta i sura miljöer.
* metan (CH₄): Metanotrofiska bakterier kan oxidera metan, en växthusgas, till koldioxid (CO₂), erhålla energi i processen. Detta är viktigt för att reglera atmosfäriska metannivåer.
* sulfite (so₃²⁻): Vissa bakterier kan oxidera sulfit till sulfat (so₄²⁻) och frigöra energi. Denna process används i olika industriella applikationer.
Dessa energikällor finns ofta i miljöer som är hårda och extrema, såsom djuphavsöppningar, vulkaniska områden och sura miljöer. Kemoautotrofer spelar en avgörande roll i dessa ekosystem genom att tillhandahålla den primära energikällan för andra organismer.
