I sitt första experiment studerade Mendel nedärvningen av en egenskap, fröfärg, hos ärtväxter. Han korsade rena växter med gröna frön och rena växter med gula frön. F1-generationen (första filial generationen) producerade endast gulfröade växter. Detta resultat antydde att allelen för gula frön var dominant över allelen för gröna frön.

Mendel lät sedan F1-växterna självbefrukta. F2-generationen producerade både gulfröiga och grönfröiga växter i ett förhållande av cirka 3:1. Detta resultat antydde att F1-växterna var heterozygota för fröfärg, vilket betyder att de bar både den dominanta allelen för gula frön och den recessiva allelen för gröna frön.

Mendels första experiment gav bevis för arvets partikelform och dominansen av vissa alleler över andra. Det lade också grunden för hans efterföljande experiment om nedärvning av flera egenskaper och utvecklingen av hans teori om ärftlighet.