* Storlek: Mitokondrier är mycket små organeller, som vanligtvis mäter några mikrometer i längd. Ljusmikroskop saknar upplösning för att visualisera sådana små strukturer.
* Intern struktur: TEM möjliggör visualisering av den inre strukturen i mitokondrier, inklusive cristae (vikta membran) och matris. Denna detaljnivå är avgörande för att förstå mitokondriell funktion.
* elektronfärgning: TEM använder tungmetallfläckar som förbättrar kontrasten i mitokondrierna, vilket gör dem lättare att se mot cellens bakgrund.
Medan ett ljusmikroskop kan användas för att observera jästceller, kommer det inte att avslöja detaljerna i deras inre organeller som mitokondrier.
