* redundans: Växter har ofta flera gener som utför liknande funktioner. Om en gen slås ut, kan en annan gen ta över sin roll och maskera effekten av mutationen. Detta kallas genetisk redundans.
* villkorade effekter: Mutationen kan bara ha en effekt under specifika miljöförhållanden (t.ex. stress, näringsbrist, specifika temperaturer). Under normala förhållanden kan växten tyckas identisk med den vilda typen.
* subtila fenotyper: Mutationen kan orsaka en förändring i en fysiologisk process som inte är lätt synlig för det blotta ögat. Detta kan inkludera förändringar i metabolism, hormonnivåer eller genuttryck.
* ofullständig knockout: Knockouten kanske inte helt eliminerar genens funktion. Det kan fortfarande finnas en viss restaktivitet, eller så kan genen delvis slås ut, vilket leder till en mindre allvarlig effekt.
* Utvecklingsstadium: Fenotypen kanske bara är synlig i ett specifikt utvecklingsstadium. Till exempel kan mutationen påverka fröspiring men inte ha en synlig effekt på vuxna växter.
Hur man upptäcker dolda fenotyper:
Även om en knockout -mutant inte visar en synlig fenotyp är det möjligt att upptäcka förändringar på molekylnivå med olika tekniker:
* genuttrycksanalys: RNA -sekvensering eller qPCR kan användas för att bestämma om uttrycket av andra gener förändras i mutanten.
* proteinanalys: Western blotting eller andra tekniker kan användas för att mäta proteinnivåer och deras aktivitet.
* biokemiska analyser: Dessa kan användas för att mäta förändringar i metaboliska vägar eller enzymaktivitet.
* Fysiologiska studier: Analys av växtens svar på specifika stimuli (t.ex. stress, ljus, näringsämnen) kan avslöja subtila skillnader mellan den mutanta och vilda typen.
Avslutningsvis: Även om en knockout -mutant kan verka identisk med den vilda typen, betyder det inte att det inte finns några förändringar. Ytterligare undersökningar är ofta nödvändiga för att avslöja dolda fenotyper och förstå konsekvenserna av gen knockout fullt ut.
