Använda fragmentbaserade metoder för att upptäcka nya antibiotika. Kredit:Bas Lamoree och Roderick E. Hubbard
I julinumret 2018 av SLAS Discovery , en översiktsartikel sammanfattar nya metoder för fragment-baserad blyupptäckt (FBLD) för att identifiera nya föreningar som potentiella antibiotika.
Författarna Bas Lamoree och Roderick E. Hubbard från University of York (Storbritannien) förklarar hur FBLD fungerar och illustrerar dess fördelar gentemot konventionell screening med hög genomströmning (HTS). Specifikt, hur FBLD ökar chanserna att hitta träffar; hur dess metoder kan leverera träffar utan de massiva investeringar som krävs för HTS; och hur genom att börja smått, FBLD ger läkemedelskemister fler möjligheter att bygga fler läkemedelsliknande föreningar. Dessa principer illustreras i granskningen och stöds av nya exempel på upptäcktsprojekt mot en rad potentiella antibiotikamål.
Ökningen av antibiotikaresistens erkänns nu som ett verkligt hot mot människors hälsa. Dock, inga nya antibiotika har utvecklats på många decennier. FBLD börjar med att identifiera lågmolekylära föreningar (fragment), som binder till proteinmål. Information om hur fragmenten binder till sina proteinmål används sedan för att odla föreningarna till potenta läkemedelskandidater. Eftersom fragmenten är små, de är mer benägna att passa in i ett bindningsställe och varje fragment representerar ett stort antal potentiella föreningar.