I en tidning publicerad i Journal of Biological Chemistry , Dr. Özdemir har studerat två proteinfamiljer som heter Rho GTPaser och IQGAPs, som är kända för att spela en viktig roll vid cancermetastaser. Dessa två "misstänkta" proteinfamiljer har studerats av många forskare genom åren, men samspelet dem emellan hade inte tidigare förståtts fullt ut.

Det är viktigt att förstå hur metastaser, spridning av cancer från dess primära plats till andra organ, äger rum, eftersom att förhindra metastaser innebär att hålla cancer under kontroll. Det är därför Dr. Özdemir valde att studera dessa proteiner, som är kända för att aktivera metastaser.

Kräver en stor mängd probabilistiska beräkningar, studien möjliggjordes endast genom beräkningssimuleringstekniker med hjälp av mycket kraftfulla datorer. Forskarna byggde en simuleringsmiljö där många sådana element som vattentätheten i cellen, jonerna och den tredimensionella strukturen av proteinerna simulerades mycket exakt. Detta gjorde det möjligt att observera exakt hur de två proteinerna interagerade, punkterna där de gränsar, och vilka morfologiska förändringar bindningen orsakade i proteinerna.

Simuleringen tog sex månader. Studien observerade bindningspunkterna och sekvensen för de två proteinerna, hur det stora proteinet hittade sin match, och hur de två komplexa strukturerna hängde ihop. Och det konstaterades att de komplexa strukturerna som bildades aktiverade de mekanismer som utlöste metastaser i celler.

Dr. Sıla Özdemirs studie testades och replikerades på cancerceller i laboratoriemiljö av en annan forskargrupp vid National Institutes of Health i USA (NIH), och resultaten visade en exakt matchning:Experimentet verifierade data som producerades genom datorsimuleringarna. Det viktigaste resultatet av denna upptäckt kommer att vara dess bidrag till utformningen av ett läkemedel som riktar sig mot mekanismen i fråga.

Efter dess publicering i Journal of Biological Chemistry , bland de mest prestigefyllda tidskrifterna på området, Dr. Özdemirs forskning fortsatte att publiceras som en del av en speciell samling av tidskriften över de mest inflytelserika artiklarna 2018.