Järnkänsliga regulatorer (Irr): Irr-proteiner är transkriptionella regulatorer som kontrollerar uttrycket av gener involverade i järnupptag och användning. När järnnivåerna är låga binder Irr-proteiner till specifika DNA-sekvenser och aktiverar transkriptionen av dessa gener.
Päls (järnupptagsregulator): Päls är en transkriptionsrepressor som kontrollerar uttrycket av gener som är involverade i järnupptag och användning. När järnnivåerna är höga binder Fur till specifika DNA-sekvenser och undertrycker transkriptionen av dessa gener.
Sideroforer: Sideroforer är små molekyler som produceras av bakterier för att kelera och transportera järn. Sideroforer utsöndras i miljön, där de binder till järn och bildar komplex som kan tas upp av bakterierna.
Fe-S-kluster: Fe-S-kluster är små järn-svavel-kofaktorer som är väsentliga för aktiviteten hos många enzymer. När järnnivåerna är låga minskar syntesen av Fe-S-kluster, vilket kan leda till hämning av enzymer som kräver dessa kofaktorer.
Hem: Heme är ett järninnehållande porfyrin som är väsentligt för aktiviteten hos många enzymer, inklusive cytokromer och peroxidaser. När järnnivåerna är låga minskar syntesen av hem, vilket kan leda till hämning av enzymer som kräver denna kofaktor.
ROS (reaktiva syreämnen): Järn kan också kännas av bakterier genom produktion av reaktiva syrearter (ROS). ROS produceras av Fenton-reaktionen, som uppstår när järn reagerar med väteperoxid. ROS kan skada DNA, proteiner och lipider och kan leda till celldöd. Bakterier kan använda produktionen av ROS för att känna av järnnivåer och reglera uttrycket av gener som är involverade i järnupptag och användning.
Detta är bara några av de mekanismer som kvävefixerande bakterier använder för att känna av järn. Genom att känna av järnnivåer kan bakterier reglera uttrycket av gener som är involverade i järnupptag och utnyttjande, och säkerställa att de har tillräckligt med järn för att tillgodose deras metabola behov.