Elektronerna för fotosystem II kommer från delning av vattenmolekyler. Denna process utförs av det syreevolverande komplexet (OEC) i fotosystem II. OEC är ett kluster av fyra manganjoner och en kalciumjon som hålls samman av en proteinställning. När ljusenergi absorberas av fotosystem II exciterar den en elektron i klorofyllmolekylen i reaktionscentret. Denna elektron överförs sedan till en elektronacceptor, och den når så småningom OEC. OEC använder elektronens energi för att dela en vattenmolekyl i två protoner och en syreatom. Protonerna pumpas in i tylakoidens lumen, medan syreatomen släpps ut i atmosfären.