Vätebindningar kan bara bildas när atomen är involverad i en polär kovalent bindning, där det finns en signifikant skillnad i elektronegativitet mellan de bundna atomerna. Denna skillnad i elektronegativitet skapar en partiell positiv laddning på väteatomen och en partiell negativ laddning på den mer elektronegativa atomen, vilket möjliggör bildandet av vätebindningar.