Vätebindningar är i allmänhet starkare än koordinatbindningar. Vätebindningar bildas mellan en väteatom och en elektronegativ atom såsom kväve, syre eller fluor. Den elektronegativa atomen attraherar elektronerna i vätebindningen, vilket skapar en partiell positiv laddning på väteatomen och en partiell negativ laddning på den elektronegativa atomen. Denna elektrostatiska attraktion är det som håller samman vätebindningen.

Koordinatbindningar, även kända som dativbindningar, bildas när en atom donerar ett elektronpar till en annan atom. Atomen som donerar elektronerna kallas Lewisbasen, och atomen som tar emot elektronerna kallas Lewissyran. Koordinatbindningar är svagare än vätebindningar eftersom den elektrostatiska attraktionen mellan de två atomerna är svagare. Detta beror på att elektronerna i en koordinatbindning inte delas lika mellan de två atomerna, eftersom de är i en vätebindning.

I allmänhet är vätebindningar cirka 10 gånger starkare än koordinatbindningar. Styrkan hos en vätebindning eller en koordinatbindning kan dock variera beroende på de specifika atomer som är inblandade.