Ammoniakens symmetri kan förstås i termer av molekylens molekylära orbitaler. Kväveatomen har fem valenselektroner, och dessa elektroner upptar tre sp3 hybridorbitaler. De tre sp3 hybridorbitalerna är arrangerade i en tetraedrisk form, och de tre väteatomerna är bundna till kväveatomen genom dessa orbitaler.
Den fjärde valenselektronen i kväveatomen upptar en p-orbital. Denna p-orbital är vinkelrät mot planet för de tre sp3-hybridorbitalerna, och den är ansvarig för det ensamma elektronparet på kväveatomen.
Ammoniakens symmetri kan också förstås i termer av den molekylära punktgruppen. Ammoniakens punktgrupp är C3v, vilket betyder att molekylen har en trefaldig rotationsaxel, tre vertikala spegelplan och ett horisontellt spegelplan.
Ammoniakens symmetri har ett antal viktiga konsekvenser. Till exempel betyder molekylens symmetri att de tre väteatomerna alla är ekvivalenta, och de har alla samma bindningslängd och bindningsvinkel. Molekylens symmetri gör också att molekylen har ett dipolmoment, vilket är ett mått på molekylens polaritet.