1. Antibiotika:
* penicillins: Hämta bakteriell cellväggssyntes (t.ex. penicillin G, amoxicillin)
* cephalosporins: Hämta bakteriell cellväggsyntes (t.ex. cefazolin, ceftriaxon)
* makrolider: Hämta bakterieproteinsyntes (t.ex. erytromycin, azitromycin)
* tetracykliner: Hämta bakterieproteinsyntes (t.ex. tetracyklin, doxycyklin)
* aminoglykosider: Hämta bakterieproteinsyntesen (t.ex. gentamicin, tobramycin)
* fluorokinoloner: Hämta bakteriell DNA -replikation (t.ex. ciprofloxacin, levofloxacin)
2. Svampmedel:
* azoler: Hämta svamp ergosterolsyntes (t.ex. fluconazol, ketokonazol)
* polyener: Bind till svampcellmembran (t.ex. amfotericin B, Nystatin)
* echinocandins: Hämta svampcellväggssyntes (t.ex. caspofungin, micafungin)
3. Antivirala medel:
* nukleosidanaloger: Hämta viralt DNA eller RNA -syntes (t.ex. acyclovir, oseltamivir)
* icke-nukleosid omvänd transkriptasinhibitorer (nnrtis): Hämta HIV -omvänd transkriptas (t.ex. efavirenz, nevirapin)
* proteasinhibitorer: Hämta viral proteasaktivitet (t.ex. ritonavir, indinavir)
4. Antiparasitiska medel:
* Antimalaria: Hämta parasittillväxt och utveckling (t.ex. klorokin, artemisinin)
* Antiprotozoals: Mål olika stadier av parasitlivscykler (t.ex. metronidazol, albendazol)
5. Andra antimikrobiella molekyler:
* jod: Oxiderar och skadar bakteriecellmembran
* klorhexidin: Stör bakteriecellmembranen
* väteperoxid: Producerar reaktiva syrearter som skadar bakterieceller
* silver: Stör bakteriell enzymfunktion
* Alkohol (etanol och isopropanol): Denaturer bakteriella proteiner
* fenoler: Störa bakteriecellmembran
* kvartära ammoniumföreningar: Störa bakteriecellmembran
* Bismut Subsalicylate: Hämmar bakteriell vidhäftning och toxinproduktion
Obs: Detta är inte en uttömmande lista, och det finns många andra antimikrobiella molekyler med olika verkningsmekanismer. Utvecklingen av nya antimikrobiella medel pågår och nya klasser av molekyler upptäcks ständigt.