Medan de båda tillverkas helt av kolatomer, leder skillnaden i deras struktur och bindning till deras oerhört olika egenskaper.
* diamant: har en styv, kristallin struktur där varje kolatom är bunden till fyra andra i ett tetraedralt arrangemang. Detta skapar ett mycket starkt och hårt material.
* sot: är amorft kol, vilket betyder att det saknar en regelbunden, upprepande struktur. Det består av små kolpartiklar som är löst bundna ihop. Detta ger sot sin mjuka, svarta och pulverformiga struktur.