Området under sjukdomens framstegskurva (AUDPC) är ett kvantitativt mått på sjukdomsintensitet med tiden. Det används i växtpatologi för att indikera och jämföra nivåer av resistens mot sjukdomar bland sorter av växter. Trapezoidmetoden. Det vanligaste sättet att beräkna AUDPC. Det utförs genom att använda en formel formulerad av Campbell och Madden 1990 eller genom att plotta en gradering av procentuell infektion mot tiden och summera trapezoiderna mellan tidsintervall.
Åtgärda sjukdomsprogression
Forskningsregler och riktlinjer som gäller för att mäta den specifika sjukdomen och grödan du undersöker. Den nödvändiga storleken av växtprovet varierar beroende på grödor och sjukdom. Att studera senskräftor i knölar kräver till exempel ett minimumsprov på 40 växter.
Plantera lämpligt antal plantor som krävs för studien.
Var försiktigt noga med tecken på sjukdomen. Forskning när tecken förväntas inträffa så att du är beredd. Till exempel uppträder tecken på senblod cirka 30 till 40 dagar efter plantering och 10 dagar efter den sista användningen av fungicid.
Beräkna visuellt procentandelen av smittade bladarealer i ditt prov så snart du märker sjukdomen.
Spela in procentandelen av smittade bladarealer med regelbundna tidsintervaller. Forskare tar läsa för senblod vart sjunde dag om sjukdomen fortskrider snabbare än förväntat. Läsningar tas varje 14 dagar när sjukdomsprogressionen är långsammare.
Sluta registrera infektionsmätningar när andelen infektion slutar öka och sjukdomsprogressionsnivåerna.
Beräkna AUDPC från en ekvation
Lägg till de två första infektionsprocenterna du spelade in.
Dela tilläggsresultatet med två för att hitta medelvärdet eller mittvärdet av de två mätningarna.
Multiplicera medelvärdet eller mittvärdet av tidsintervallet, vilket är antalet dagar från första behandlingen till andra behandlingen. Om du tog första behandlingen på dag 20 och andra behandlingen på dag 27, så är antalet dagar eller tidsintervall sju dagar.
Spela in resultatet i andelar av procentuella dagar. Värdet är ett område av en trapezoid.
Upprepa steg One through Four för den andra och tredje infektionsavläsningen du tog. Deras resultat blir området för en andra trapezoid. Upprepa steg en till fyra tills du har beräknat trapezformiga områden för alla mätningar.
Lägg till alla trapezoider för att hitta AUDPC. Lägre AUDPC representerar långsammare sjukdomsprogression och större motståndskraft mot sjukdomen. Högre AUDPC representerar snabbare sjukdomsprogression och högre mottaglighet för sjukdomen.
Tips
AUDPC återfinns också genom att plotta procentandelen infektion mot tiden på en graf. Området för varje trapezium mellan mätvärdena beräknas med enkel geometri.
AUDPC tillåter att tidsintervaller mellan mätvärdena varierar, men avläsningar bör börja strax efter att sjukdomen börjar. En lång fördröjning resulterar i mottagliga material som inte ingår i sjukdomsprogresskurvan.
Varning
På grund av den uppskattning som är inblandad vid bedömningen av infektionsprocenten betraktas AUDPC som en pseudokvantitativ variabel. AUDPC är bara en uppskattning av området under den faktiska infektionskurvan.
AUDPC är inte allmänt jämförbar mellan experiment på grund av olika faktorer som förekomsten av negativa eller gynnsamma sjukdomstillstånd.