Genetiskt manipulerade grödor innefattar sorter av majs, bomull och potatis. Dessa växter har en bakteriell gen från Bacillus thuringiensis (Bt) införd i deras genom. Bt-genen kodar för syntesen av ett toxin som dödar insektslarver. Andra grödor är genetiskt modifierade för att klara en specifik herbicid. Även om dessa grödor potentiellt kan mata världens växande befolkning, utgör de också allvarliga risker för den naturliga mångfalden av organismer eller biologisk mångfald.
Herbicidanvändning
Herbicider är giftiga för många arter. När en herbicid appliceras över jordbrukslandskap, kommer skadliga kemikalier in i naturliga ekosystem. Många tror att herbicidresistenta grödor uppmuntrar ökad användning av herbicider, och när fler herbicider används, hamnar ännu fler kemikalier i naturliga system. Dessa kemikalier dödar inhemska växter som matar djuren och sicken amfibier direkt, vilket medför en minskning av den biologiska mångfalden.
Utkorsning
När gener från genetiskt modifierade grödor går in i miljön har de potential att störa naturliga växtsamhällen, hotar biologisk mångfald och matar in mänskliga livsmedel. I september 2000 upptäcktes StarLink en mängd Bt-majs som inte godkändes för konsumtion i taco-skal i USA. Under de närmaste månaderna upptäcktes StarLink också i olika gulgrisprodukter, några utanför landet. Först misstänktes några odlare att ignorera avtal om att inte sälja StarLink till fabriker. Men intervjuer med odlarna visade att många inte heller hade fått tydliga instruktioner om att inte sälja StarLink till fabriker, eller att de fick höra att den ej godkända sorten skulle godkännas vid skörden. De exakta punkterna på vilka StarLink gick in i leveransledningen är fortfarande okända, och enligt en serie från Cornell Cooperative Extension's Utbildningsprojekt för genetiskt utvecklade organismer kan det ha gått in i mer än hälften av USA: s kornleveranser. >
Herbicidresistens
Områden där växtarter härrör är särskilt utsatta för utkorsning med lokala sorter. I Mexiko, där över 100 unika sorter av majs finns, är genetiskt konstruerad majs förbjuden. Trots förbudet har gener från genetiskt modifierad majs hittats i mexicansk majs. Växtgenetiker vid U.C. Riverside har visat att genflödet från många konventionellt uppfödda grödor ökar weediness hos vilda släktingar och det finns några fall där grödplantor har blivit ogräs. Ökad weediness är en oro när genetiskt manipulerade växter kan konkurrera med andra arter genom att producera mer frö, sprida ytterligare pollen eller frö eller växa mer kraftigt i specifika miljöer. Transgena solrosor kan producera 50 procent mer frö än sina traditionella motsvarigheter och vissa forskare är oroade över att genetiskt modifierade växter gradvis kan förskjuta värdefull genetisk mångfald.
Bt Toxin
De toxiner som produceras av genetiskt manipulerade grödor hotar biodiversitet, och enligt Sierra Club, bör genteknik anses vara miljöfarlig. En Cornell University-studie visar att Bt-toxinet dödar larverna av fördelaktiga, icke-målarter, som malar och fjärilar. Liknande studier indikerar en minskning av andra fördelaktiga arter, inklusive lacewings och nyckelpigor. Toxinet kvarstår också i rotsystemen av Bt majs och i växtrester långt efter att gröda skördas och kan få skadliga konsekvenser för miljontals mikroorganismer som lever i jorden och bibehåller dess fertilitet. När Bt-toxin binder till jordpartiklar kan det kvarstå i två till tre månader. Detta kan få negativa konsekvenser för ryggradslösa vattendjur och råtta, liksom näringscykelprocesser som förekommer hos bakteriearter.