Varje punkt bildas från den konstruktiva störningen av röntgenstrålar som passerar genom en kristall. Data kan användas för att undersöka kristallens struktur. Upphovsman:M. Grabowski et al.
Reproducerbarheten av publicerade experimentella resultat har nyligen väckt uppmärksamhet inom många olika vetenskapliga områden. Bristen på tillgång till ursprungliga primära vetenskapliga data utgör en stor faktor som bidrar till reproducerbarhetsproblem, dock, strukturbiologins gemenskap har tagit betydande steg mot att göra experimentella data tillgängliga.
Makromolekylär röntgenkristallografi har lett vägen för att kräva offentlig spridning av atomkoordinater och en mängd experimentella data via Protein Data Bank (PDB) och liknande projekt, vilket gör fältet till ett av de mest reproducerbara inom biologiska vetenskaper.
IUCr beställde Diffraction Data Deposition Working Group (DDDWG) 2011 för att undersöka fördelarna och genomförbarheten med att arkivera råa diffraktionsbilder i kristallografi. DDDWG:s triennialrapport 2011-2014 gav flera viktiga rekommendationer angående bevarandet av rådiffraktionsdata. Dock, det finns inget mandat för offentliggörande av de ursprungliga diffraktionsuppgifterna.
Den integrerade resursen för reproducerbarhet i makromolekylär kristallografi (IRRMC) är en del av Big Data to Knowledge -programmet från National Institutes of Health och har utvecklats för att arkivera rådata från diffraktionsförsök och, lika viktigt, att tillhandahålla relaterade metadata. Databasen [Grabowski et al. (2016). Acta Cryst. D72, 1181-1193, DOI:10.1107/S2059798316014716], innehåller i skrivande stund 3070 makromolekylära diffraktionsförsök (5983 datamängder) och deras motsvarande delvis kuraterade metadata, står för cirka 3% av alla insättningar i Proteindatabanken. Resursen är tillgänglig på http://www.proteindiffraction.org och kan sökas med olika kriterier via en enkel, strömlinjeformat gränssnitt. All data är tillgänglig för obegränsad åtkomst och nedladdning. Resursen fungerar som ett bevis på konceptet och visar möjligheten att arkivera rådiffraktionsdata och tillhörande metadata från röntgenkristallografiska studier av biologiska makromolekyler.
Prata med en reporter om projektet, lagledare Wladek Minor sa, "Det pågår så mycket forskning att allt inte kan publiceras, och ofta visas resultaten av misslyckade studier inte i litteraturen. Jag tror att nyckeln till framgång är att veta om misslyckade experiment, vi vill veta varför de misslyckas ".
Målet med projektet är att expandera IRRMC och inkludera datauppsättningar som inte gav röntgenstrukturer. Detta kan underlätta samarbetsinsatser för att förbättra metoderna för bestämning av proteinstrukturer och även säkerställa tillgängligheten av "föräldralösa" data som lämnats efter av enskilda utredare och/eller utdöda strukturgenomiska projekt.