En biokemist från Purdue University har utvecklat en ny metod för att upptäcka vissa typer av proteiner som fungerar som indikatorer för cancer och andra sjukdomar.

Glykoproteiner bildas när sockerarter binder till och modifierar ett protein. I vissa fall, en kombination av glykoproteiner som finns i ett blod- eller urinprov kan vara en indikator på sjukdom eller cancer.

Men de glykoproteinerna kan vara svårfångade. Det har inte funnits någon antikropp för att skilja mellan dem och vanliga proteiner. Och de komplexa och skrymmande sockergrupperna kan göra det svårt för även standardproteindetekteringsantikroppar att hitta sina mål.

W. Andy Tao, en Purdue professor i biokemi, har utvecklat en ny proteinuppsättning, en hög genomströmningsplattform för att analysera flera proteiner parallellt, för att separera glykoproteiner från omodifierade proteiner. Tao visade också sin effektivitet för att identifiera glykoproteiner associerade med cancer i urinblåsan. Iakttagelserna publicerades måndag (14 november) i Journal of the American Chemical Society .

Tao utvecklade en polymer i nanostorlek, kallas polyGPA, som fäster vid sockergrupperna av glykoproteiner och för dem till ytan av proteinarrayen. Nanopolymeren ompositionerar också glykoproteinet så att antikropparna som används för att detektera omodifierade proteiner bättre kan nå sina mål.

"Det finns många sockertyper och kombinationer. Sockermodifiering kan vara en mycket viktig indikation på sjukdomstillstånd, " Sade Tao. "En panel av proteiner modifierade av sockerarter kan vara en indikation på en viss sjukdom."

Tao sa att tester visade att hans metod är 17 gånger till 25 gånger mer sannolikt att identifiera proteiner som annars skulle ha missats i vanliga testprocedurer. Han kunde också identifiera glykoproteiner associerade med blåscancer i ett urinprov.

"Det är möjligt att använda vår plattform för att identifiera dessa sockermodifierade proteiner som en biomarkör för blåscancer, " sa Tao.

Tao kommer att arbeta för att kommersialisera sin nanopolymermodifierade proteinuppsättning genom sitt företag, Tymora Analytical Operations, som verkar i Purdue University Research Park. Företaget tillverkar pIMAGO nanopolymer, som kan användas för att avgöra om cancerläkemedel har varit effektiva mot biokemiska processer som kan leda till cancercellbildning, och polyMAC, en nanopolymer som hjälper forskare att hämta och studera proteiner som genomgår processer relaterade till cancercellbildning.