Uttrycket "morfologi" beskriver en organisms form, form eller tillväxtvanor och dess delar. Alger uppvisar extremt varierande morfologi. Några som Chlorella är enhälliga organismer som liknar bakterier, medan andra som kelp är komplexa, multicellulära organismer med celler som liknar växter. Andra alger driver gamuten av morfologisk mångfald, men kan kategoriseras i flera huvudgrupper.

Unicellular

Encelliga alger består av en enda cell. Kroppens enda cell innehåller en kloroplast som leder fotosyntes för att skapa energi från solljus och innehåller ofta en struktur som kallas en pyrenoid som kan lagra energi och kontraktil vacuoler som hjälper till att reglera mängden vatten och salter i cellen (dvs. osmoregulation). Vissa unicellularalger som Chlamydomonas är motila, eller kan flytta, med flagella.

Colonial

Kolonialalger innehåller olika antal celler. Vissa, till exempel Gonium, består av en liten grupp celler, medan andra, till exempel Volvox, består av hundratals celler. Specialiserade kolonier som heter coenobium innehåller ett specifikt antal celler, var och en med sina egna uppgifter, som inte kan överleva ensam. I likhet med unicellularalger är många kolonala alger motila.

Filamentösa

Filamentala alger genomgår celldelning men förbinder sig och bildar långa filament av bifogade celler. Varje cell i den trådformiga algen har sina egna interna strukturer, såsom en kloroplast, och kan fotosyntes. Spirogyra är en allmänt studerad alg. Vid lågvatten exponeras dessa strängiga gröna alger på stenar. Under mikroskopet avslöjar Spirogyra ett unikt spiralarrangemang av kloroplaster.

Sifona

Sifona alger har en morfologi som överflödigt liknar filamentösa alger. Sifona alger består emellertid av en enda cell med förgreningsdelar. Enteromorpha är en sifonalger som liknar Spirogyra till det blotta ögat.

Parenkymatiska

Vissa röda alger innehåller boxiga, växtliknande celler och har en komplex, multicellulär struktur som kallas "parenkymatisk ." Trots att cellerna i alger inte skiljer sig åt för att bilda olika strukturer, har dessa parenkymatiska alger ofta delar som liknar löv, stjälkar och rötter. Kelp växer till enorma längder, och är kanske en av de mest kända parenkymatiska algerna.