Tarmbakterien E. coli kan anpassa sig till förändringar i sin omgivning. Leiden-forskare har upptäckt hur H-NS-proteinet gör detta möjligt. Denna nya kunskap kan vara en viktig utgångspunkt för att bekämpa bakterier och sjukdomar som bukhinneinflammation. Publicering 2 oktober i tidskriften eLife.

E.coli är ansvarig för alla typer av sjukdomar, inklusive peritonit, och är också en av orsakerna till matförgiftning. Denna bakterie innehåller proteinet H-NS, som kan koppla på och stänga av bakteriens gener. Genom att slå på och av dessa gener kan bakterien överleva förändringar i sin omgivning, såsom en ökning eller sänkning av temperaturen. Ramon van der Valk från Leiden Institute of Chemistry har upptäckt exakt hur denna process fungerar. Denna kunskap kan ligga till grund för att utveckla nya antibiotika för att bekämpa E. coli-bakterien (och andra).

H-NS upptäcker själv förändringar i miljön

Så länge sedan som år 2000, min kollega Remus Dame upptäckte hur H-NS-proteinet stänger av särskilda gener i E. coli-bakterien, ' förklarade Van der Valk. "Men vi visste inte hur dessa gener kan slås på igen. Det visar sig nu att H-NS tar emot signaler från omgivningen om det sker en förändring i bakteriens omgivning, och som en reaktion på detta kopplas generna på igen.' Tack vare Van der Valks och hans kollegors arbete, denna process har nu kartlagts. H-NS själv verkar kunna upptäcka förändringar, inklusive förändringar i temperatur och natriumhalt.

Studien var ett samarbete mellan universiteten i Leiden, Amsterdam, och Heidelberg (D), där forskarna tillämpade ett multidisciplinärt förhållningssätt för att undersöka hur H-NS fungerar och dess påverkan på miljön. "Studien fokuserade på olika signaler från miljön som proteinet reagerade på, såsom temperatur, pH eller förändringar i saltkoncentrationen. Genom att använda biokemiska och biofysiska metoder i kombination med datorsimuleringar, vi kunde analysera effekten av dessa symboler på H-NS. I ett provrör, vi kunde då påverka hur N-NS binder till DNA.'

Fynden av Van der Valk och hans kollegor har publicerats i tidskriften eLife .