Genomsammansättning är processen att sätta ihop de fragment av DNA som sekvenseras i ett genomprojekt. Det traditionella tillvägagångssättet för genommontering använder en process som kallas "hierarkisk sammansättning", som börjar med att de minsta fragmenten av DNA sätts samman till större sammansättningar, som sedan sätts samman till byggnadsställningar och slutligen till kromosomer.
Emellertid kan hierarkisk sammansättning vara felbenägen, särskilt i områden av genomet som är mycket repetitiva eller innehåller strukturella varianter. Gles sammanslagning tar itu med dessa problem genom att använda ett annat tillvägagångssätt som börjar med de största fragmenten av DNA och sedan successivt smälter samman dem.
Det första steget i gles sammanslagning är att skapa en "gles sammansättning" genom att identifiera de längsta DNA-fragmenten som entydigt kan sättas ihop. Dessa fragment slås sedan samman med en kombination av beräknings- och experimenttekniker. Beräkningsteknikerna identifierar områden med överlappning mellan fragmenten, medan de experimentella teknikerna verifierar noggrannheten av sammanslagningarna.
Den resulterande glesa sammansättningen fylls sedan i genom att sätta ihop de mindre fragmenten av DNA. Denna process upprepas tills hela genomet har satts ihop.
Den glesa sammanslagningsmetoden har ett antal fördelar jämfört med traditionell hierarkisk sammansättning. För det första är det mer exakt, eftersom det undviker de fel som kan uppstå när man sätter ihop små DNA-fragment. För det andra är den mer komplett, eftersom den kan sätta ihop regioner av genomet som är svåra att montera med traditionella metoder. För det tredje är det snabbare, eftersom det inte kräver den tidskrävande processen att sätta ihop små DNA-fragment.
Den sparsamma sammanslagningsmetoden kan ha stor inverkan på genomikområdet. Det skulle kunna göra det möjligt att sammanställa genom snabbare, exakt och fullständigt, vilket skulle öppna nya vägar för forskning inom områden som medicin, evolution och bevarandebiologi.
