Oligosackaridproteintransferaskomplexet är sammansatt av flera subenheter, inklusive den katalytiska subenheten (OST-A), den regulatoriska subenheten (OST-B) och de accessoriska subenheterna (OST-C, -D och -E). Den katalytiska subenheten är ansvarig för överföringen av oligosackariden från den dolichol-kopplade prekursorn till asparaginresten, medan den regulatoriska subenheten kontrollerar aktiviteten hos den katalytiska subenheten. Tillbehörsunderenheterna är involverade i sammansättningen och stabiliteten av komplexet.