* Tidiga jordförhållanden: Den tidiga jorden var en hård miljö, utan syre i atmosfären och extrema temperaturer. Prokaryoter utvecklades till att trivas under dessa förhållanden, medan eukaryoter, med sina mer komplexa strukturer, troligen inte kunde ha överlevt.
* enklare struktur: Prokaryoter är enklare organismer som saknar de komplexa inre strukturerna (som en kärna och membranbundna organeller) som finns i eukaryoter. Denna enklare struktur tillät dem att utvecklas och reproducera snabbare och anpassa sig till de förändrade förhållandena för tidig jord.
* fossil bevis: Det äldsta fossila beviset på livet på jorden är av prokaryoter, som går tillbaka miljarder år. De första eukaryoterna visas mycket senare i fossilregistret.
* endosymbiotisk teori: Den rådande teorin är att eukaryoter utvecklades från prokaryoter genom en process som kallas endosymbios. Detta involverar en större prokaryot som uppslukar en mindre, som så småningom blev en organell (som mitokondrier eller kloroplaster) i den större cellen. Detta antyder att prokaryoter redan fanns före utvecklingen av eukaryoter.
I huvudsak var prokaryoter pionjärerna i livet på jorden, anpassade och utvecklas för att överleva i en utmanande miljö. Eukaryoter, med sina mer komplexa strukturer, dök upp senare, troligen utvecklades från prokaryoter själva.
