1. Förorening: Damm, smuts, fingeravtryck och till och med luftburna partiklar kan ackumuleras på linserna och andra känsliga delar av mikroskopet. Denna förorening kan sprida ljus, hindra bilden och till och med skrapa de känsliga linserna.
2. vibration: Mikroskop är extremt känsliga instrument. Till och med små vibrationer, vare sig från fottrafik, närliggande maskiner eller till och med en liten stöt, kan oskärpa bilden och göra det svårt att fokusera.
Dessa utmaningar är inte inneboende "fiender" i traditionell mening, men de kan vara stora hinder för att rensa och korrekt visning under ett mikroskop.
