1. metanogener: Dessa är strikta anaerober som producerar metan som en biprodukt av deras metabolism. De finns ofta i miljöer som träsk, tarm av djur och till och med avloppsreningsverk.

2. halofiler: Dessa archaea trivs i extremt salt miljöer, som salt sjöar och saltlägenheter. Vissa arter kan till och med tolerera saltkoncentrationer så höga som 30%.

3. Termofiler: Som deras namn antyder älskar dessa archaea värme. De finns ofta i varma källor, hydrotermiska ventiler och andra miljöer med temperaturer över 80 ° C.