Här är några exempel:
* smai :Detta begränsningsenzym känner igen sekvensen CCCGGG och skär direkt i mitten, vilket skapar trubbiga ändar.
* ecorv :Detta enzym känner igen sekvensen GATATC och skär också direkt i mitten och producerar trubbiga ändar.
* alui :Detta enzym känner igen sekvensen AgCT och skär mellan G och C, vilket skapar trubbiga ändar.
däremot, enzymer som skapar klibbiga ändar skär DNA asymmetriskt , lämnar överhäng av enkelsträngat DNA. Dessa överhäng kan sedan baspar med kompletterande överhäng på andra DNA-fragment, vilket möjliggör sammankoppling av olika DNA-molekyler.
Exempel på enzymer som skapar klibbiga ändar inkluderar:
* ecori :Detta enzym känner igen sekvensen GAATTC och skär mellan G och A, vilket lämnar ett 5' -överhäng.
* hindiii :Detta enzym känner igen sekvensen AAGCT och skär mellan A och A och lämnar ett 5' -överhäng.
* bamhi :Detta enzym känner igen sekvensen GGATCC och skär mellan G och G, vilket lämnar ett 5' -överhäng.