1. Bakterier: Denna domän innehåller de flesta prokaryoter som vi är bekanta med, från de som finns i jord och vatten till de som bor i extrema miljöer.

2. archaea: Denna domän består av encelliga organismer som ursprungligen klassificerades som bakterier men nu erkänns som olika från dem på grund av deras unika biokemi, genetik och fysiologi. Många archaea trivs i extrema miljöer som varma källor, salt sjöar och hydrotermiska ventiler.