Darwins teori om evolution genom naturligt urval introducerade emellertid idén om härkomst med modifiering . Detta innebar att arter var relaterade genom en delad förfäder och deras likheter återspeglade deras evolutionära historia.
Detta ledde till en fylogenetisk tillvägagångssätt för klassificering, där relationer baserades på evolutionär historia snarare än bara likheter. Denna förskjutning resulterade i:
* betoning på evolutionära relationer: Klassificeringarna började återspegla de evolutionära förhållandena mellan organismer och gruppera arter som delade en gemensam förfader.
* hierarkisk klassificering: Det hierarkiska systemet för klassificering (rike, fily, klass, ordning, familj, släkte, arter) blev närmare kopplad till organismernas evolutionära historia.
* dynamisk klassificering: Klassificeringen blev mer dynamisk, eftersom nya upptäckter och evolutionära relationer avslöjades, vilket krävde förändringar i hur organismer grupperades.
Evolutionsteorin flyttade således klassificering från ett statiskt, typologiskt system till ett dynamiskt, evolutionärt ram , ger ett mycket mer exakt och insiktsfullt sätt att förstå mångfalden i livet på jorden.
