Flagella är piskliknande strukturer som roterar för att driva bakterierna genom sin miljö. De är gjorda av protein och kan ordnas i olika mönster, som en enda flagellum i ena änden (monotrichous), en tuft av flagella i ena änden (lophotrichous), flagella över hela ytan (peritrichous) eller en flagellum i varje ände (amfitrichous).