Här är en uppdelning av vad som gör en filotyp:
* baserat på DNA -sekvenser: Fylotyper definieras av de unika sekvenserna för en specifik gen eller genetisk region, vanligtvis med en specifik tröskel för hur liknande sekvenserna måste vara för att betraktas som samma filotyp.
* inte nödvändigtvis en art: En filotyp kan motsvara en känd art, men den kan också representera en grupp nära besläktade organismer som inte formellt klassificerats som en art.
* Användbart för att studera mikrobiella samhällen: Fylotyper är särskilt viktiga för att studera mikrobiella samhällen, där traditionella taxonomiska metoder ofta är svåra eller omöjliga att tillämpa på grund av den stora mångfalden av mikroorganismer.
Här är några viktiga punkter om filotyper:
* De är operativa taxonomiska enheter (OTUS): Fylotyper används ofta omväxlande med termen "operativ taxonomisk enhet" (OTU), som hänvisar till alla grupper av organismer som anses vara en distinkt enhet för analys.
* De kan definieras på olika taxonomiska nivåer: En filotyp kan representera en art, ett släkte eller en mer specifik taxonomisk grupp, beroende på den valda genen och sekvenslikhetströskeln.
* de är dynamiska: Filotypdefinitioner kan revideras när mer sekvensdata blir tillgängliga och vår förståelse för mikrobiell mångfald utvecklas.
Sammanfattningsvis: Fylotyper är ett kraftfullt verktyg för att förstå mikrobiell mångfald och utveckling. De tillåter forskare att gruppera organismer baserat på deras genetiska förhållanden, även om traditionella taxonomiska metoder inte är genomförbara. Detta är särskilt viktigt i studien av mikrobiella samhällen, där att identifiera och klassificera enskilda arter kan vara en utmaning.
