Det finns en överraskande mängd information lagrad i den härdade plattan, eller kalkyl, mellan tänderna. Och om den kalkylen tillhör resterna av en person som levde i antiken, informationen kan avslöja nya insikter om det förflutna. Men de små proverna kan vara svåra att arbeta med. Nu, i ACS' Journal of Proteome Research , forskare tillämpar en ny metod för denna analys, hitta fler proteiner än traditionella metoder.

Den mänskliga munnen är full av intressanta molekyler:DNA och enzymer i saliv, proteiner och lipider från matbitar som fastnat mellan tänderna, de bakteriella medborgarna i det orala mikrobiomet. Under rätt förutsättningar, dessa molekyler kan bevaras i tandsten i tusentals år. Att identifiera de biomolekyler som finns bevarade i forntida plack ger forskare ledtrådar om hur våra förfäder levde, vad de åt, vilka sjukdomar de hade och mer. Dock, det finns bara så mycket plack man kan skrapa bort från gamla tänder, så det är viktigt att använda metoder som kan extrahera mest information från små prover. Även om det inte finns någon standardmetod för kalkylanalys, filterbaserade tekniker används ofta, men de kan vara tidskrävande och kan införa föroreningar. Så, team ledda av Michael Buckley och Cheryl Makarewicz ville se om en annan metod, kallas single-pot, fastfasförstärkt provberedning (SP3), kan förbättra antalet och komplexiteten hos proteinfragment som kan analyseras från bevarad plack.

Forskarna, ledd av Karren Palmer, tillämpade SP3 på analysen av kalkyl från 153 forntida individer från mellan 1 ^st och 4 ^th århundradet f.Kr. Med SP3, funktionaliserade magnetiska pärlor greppade på proteinfragment, vilket gör dem lätta att analysera med masspektrometri. Forskarna fann att SP3 på ett tillförlitligt sätt ökade antalet unika proteinfragment de kunde identifiera i prover, inklusive mindre peptider än två andra metoder, ultrafiltrering och acetonfällning, missat. SP3 var också lätt att utföra och mindre sannolikt att introducera föroreningar än de andra metoderna. Genom att använda detta tillvägagångssätt, forskarna identifierade fragment av mejeriproteiner från försökspersonernas dieter, samt bakterieproteiner som kunde kasta ljus över uråldriga sjukdomar.