Protoneringen av Tris-bas av HCl kan representeras enligt följande:

$$Tris + HCl → TrisH^+ + Cl^-$$

I denna reaktion accepterar Tris-basen (som är en svag bas) en proton (H+) från HCl (som är en stark syra), vilket resulterar i bildandet av TrisH+-katjonen (som är en svag syra) och kloridjonen (Cl-).