Ett antikodon är en sekvens av tre nukleotider som finns i en transfer RNA (tRNA) molekyl som är komplementär till en specifik kodonsekvens i messenger RNA (mRNA). Under proteinsyntesen känner antikodonet av tRNA-molekylen igen och binder till den komplementära kodonsekvensen på mRNA, vilket säkerställer korrekt inkorporering av aminosyror i den växande polypeptidkedjan.

Här är en detaljerad förklaring av hur antikodonet fungerar:

1. Under transkriptionen transkriberas en gens DNA-sekvens till en mRNA-molekyl. Varje kodon, som består av tre på varandra följande nukleotider, specificerar en viss aminosyra.

2. tRNA-molekylen, som bär en aminosyra som är specifik för dess antikodon, går in i ribosomen.

3. Ribosomens lilla subenhet skannar mRNA-sekvensen tills den hittar startkodonet, vilket vanligtvis är AUG.

4. tRNA-molekylen med det komplementära antikodonet till startkodonet binder till mRNA:t. Detta tRNA är känt som initiator-tRNA och bär metionin, den första aminosyran i proteinet.

5. Ribosomen rör sig sedan längs mRNA:t i en 5'- till 3'-riktning, vilket för in nästa kodon till avkodningsstället.

6. En annan tRNA-molekyl, med ett antikodon som är komplementärt till kodonet i avkodningsstället, binder till mRNA:t. tRNA-molekylen som bär metionin frigörs från ribosomen.

7. Aminosyran från det nybundna tRNA:t läggs till den växande polypeptidkedjan genom en process som kallas peptidbindningsbildning.

8. tRNA-molekylen som levererade aminosyran frisätts från ribosomen och lämnar det tomma stället tillgängligt för nästa tRNA att binda.

9. Processen med kodonigenkänning och aminosyratillsats fortsätter tills ett stoppkodon uppnås på mRNA:t. Ribosomen frisätter den färdiga polypeptidkedjan och tRNA-molekylerna återvinns.

Noggrannheten i proteinsyntesen är beroende av korrekt igenkänning och bindning av antikodonet till dess komplementära kodon. Denna process säkerställer att de lämpliga aminosyrorna införlivas i den växande polypeptidkedjan, vilket leder till syntesen av funktionella proteiner.