* pyrofosfat (PPI): Detta är en molekyl som består av två fosfatgrupper kopplade samman. Det frigörs under bildandet av fosfodiesterbindningen mellan fosfatgruppen av en nukleotid och en annan socker.
* vatten (H₂O): Detta frigörs under kondensationsreaktionen som kopplar nukleotidbasen till sockermolekylen.
Här är en uppdelning av processen:
1. aktivering: Ett nukleosidtrifosfat (NTP) som ATP, GTP, CTP eller TTP aktiveras. Detta involverar brytning av en högenergibindning inom NTP och frisätter pyrofosfat (PPI).
2. Attachment: Den aktiverade nukleotiden, nu ett nukleosidmonofosfat (NMP), är fäst vid den 3 'hydroxylgruppen i en växande polynukleotidkedja. Detta involverar en kondensationsreaktion som frigör vatten (H₂O).
Sammanfattningsvis:
* nukleotidsyntes involverar bildningen av en fosfodiesterbindning och en kondensreaktion, frisläppande pyrofosfat (PPI) och vatten (H₂O) respektive.
Viktig anmärkning: Pyrofosfat (PPI) delas vidare upp i två oorganiska fosfatmolekyler (PI) av ett enzym som kallas pyrofosfatas. Denna reaktion är mycket gynnsam och driver nukleotidsyntesreaktionen framåt.
