* koraller
* blötdjur
* foraminifera
* alger
Dessa organismer extraherar kalciumkarbonat från havsvatten och använder det för att bygga sina hårda delar. När de dör samlas deras skelett på havsbotten och cementeras så småningom av tryck och kemiska processer och bildar kalksten.
Medan kalksten kan bildas genom kemisk utfällning av kalciumkarbonat i vissa fall är den stora majoriteten av kalkstenen biogen i ursprung .