Här är en uppdelning:

* hydrofob effekt: Vattenmolekyler är polära och bildar starka vätebindningar med varandra. Icke -polära molekyler (som hydrofoba sidokedjor) stör dessa vätebindningar och är därför ogynnsamma i en vattenhaltig miljö. För att minimera denna störning kluster hydrofoba sidokedjor samman i proteinets inre, bort från vattnet.

* Stabilisering: Denna kluster drivs inte av en direkt attraktion mellan hydrofoba sidokedjor. Istället är det en följd av den ökade entropin (störningen) av de omgivande vattenmolekylerna när de hydrofoba grupperna begravdes i proteinet. Denna ökning av entropi driver vikningsprocessen och stabiliserar den vikta proteinstrukturen.

Sammanfattningsvis drivs hydrofoba sidokedjor i ett protein att samlas i en vattenhaltig miljö för att minimera störningen av vattenmolekyler och öka systemets totala entropi. Detta är en viktig drivkraft i proteinvikning.