När klor tillsätts till vatten reagerar det för att bilda hypoklorsyra (hocl) och saltsyra (HCl) .

Reaktionen är:

Cl₂ + H₂O ⇌ HOCL + HCL

Hypoklorsyra (HOCL) är det primära desinfektionsmedel i klorerat vatten. Det är en stark oxidationsmedel som dödar bakterier och virus genom att störa deras cellmembran och enzymer.

Medan saltsyra (HCl) också bildas, spelar den en mindre viktig roll i desinfektion.

Det är viktigt att notera att reaktionen är reversibel. Detta innebär att hypoklorsyran kan bryta ner i klor och vatten, särskilt i solljus.