* Kalciumfosfat (Ca₃ (Po₄) ₂) :Detta ger kalcium- och fosfatjonerna som bildar mineralets grundstruktur.
* Kalciumhydroxid (CA (OH) ₂) :Detta bidrar med hydroxidjonerna (OH⁻) som ger hydroxyapatit sitt namn och unika egenskaper.
Även om dessa är de viktigaste komponenterna, kan spårmängder av andra element, som fluorid, klorid och karbonat, införlivas i hydroxyapatitstrukturen.
