1. polaritet och laddning: Lipid-tvåskiktet består av fosfolipider, som har ett hydrofilt (vattenälskande) huvud och ett hydrofobt (vattenframt) svans. Detta skapar en barriär som är svår för polära molekyler och laddade joner att tränga igenom. Polära molekyler, som sockerarter och aminosyror, har en ojämn fördelning av elektrisk laddning, vilket gör att de lockas till vatten och avvisas av membranets hydrofoba inre. På liknande sätt avvisas också laddade joner, som natrium och klorid, av de hydrofoba svansarna.
2. Storlek: Stora molekyler, även om de är icke-polära, kan kämpa för att pressa genom de trånga utrymmena mellan fosfolipidsvansarna. Bilskiktet har ett relativt litet utrymme för molekyler att röra sig och fungera som en storleksbarriär.
Kort sagt fungerar lipid-tvåskiktet som en selektiv barriär, vilket gör att små, icke-polära molekyler kan passera genom lätt, samtidigt som man begränsar passagen av större, polära molekyler och laddade joner.