Konturkarta som visar den summerade totala återvinningen av märkt N-glykan från cetuximab över en rad temperaturer för proteindenaturering (60C till 90C) längs X-axeln och de-N-glykosylering (40C till 60C) längs Y-axeln. Kredit:Corey Reed
En ny original forskningsrapport tillgänglig i förväg på SLAS-teknik demonstrerar halvautomatiseringen av ett GlycoWorks RapiFluor-MS (RFMS) Kit med hjälp av en pipetteringsrobot för att förbättra produktiviteten inom biovetenskaplig forskning. Denna robotplattform använder vanliga manuella pipetter och en optiskt styrd arm för att underlätta automatiseringen av manuella procedurer, att minska den tid som forskare tillbringar vid labbbänken, och härma, så nära som möjligt, resultaten som erhålls när man använder det manuella GlycoWorks RFMS-protokollet.
GlycoWorks RapiFluor-MS (RFMS) Kit lanserades 2015 och förenklar hur forskare kan frigöra och märka N-länkade glykaner. Kitet gör det möjligt för analytiker att utföra en högavkastande provberedning och säkerställer exakta och repeterbara N-glykanprofiler. RFMS-taggen är unik genom att den ger snabb taggning och överlägsen känslighet för både optiska och masspektrometriska analyser.
Författare Corey Reed, Jennifer Fournier och Stephan Koza från Waters Corporation (Milford MA) och Nikolas Vamvoukas från Andrew Alliance förenklar detta provberedningsprotokoll ytterligare genom automatisering med hjälp av en kommersiellt tillgänglig robotlösning från Andrew Alliance. Andrew, pipetteringsroboten, presenterar en idealisk plattform för automatisering av detta kit med sin förmåga att pipettera låga volymer och anpassa sig till volymvariationer med anpassade dominon som byggts specifikt för denna lösning.
För att exakt återge resultaten av det manuella protokollet, temperaturkänsliga steg är omoptimerade för den automatiserade plattformen och en rad temperaturer testas för att uppnå maximal frigöringseffektivitet för N-glykan. Efter mindre justeringar, det automatiserade protokollet visar sig vara statistiskt jämförbart med det manuella protokollet när det gäller återvinning av RFMS-märkta N-glykaner såväl som de resulterande fluorescens relativa toppområdena. Dessutom, en underrutin i proceduren förenklar normaliseringsprocessen för provkoncentrationen före RFMS-protokollet, sparar användarna avsevärda mängder tid.
I slutet, författarna använder ett robust och lättanvänt protokoll och utökar framgångsrikt fördelarna med biovetenskaplig forskning genom att öka laboratorieproduktiviteten. Användare kan nu sömlöst gå över från det manuella protokollet till den automatiserade lösningen, befriar användare från monoton pipettering och kontrollerar nyckelområden i protokollet som normalt är utsatta för användarfel.